大多数酵母菌为单细胞，一般呈卵圆形、圆形、圆柱形或柠檬形。大小约1-5×5-30µm。*长的可达100µm。各种酵母菌有其一定的大小和形态(图2-106)，但也随菌龄及环境条件而异。即使在纯培养中，各个细胞的形状、大小亦有差别。有些酵母菌细胞与其子代细胞连在一起成为链状，称为假丝酵母。
酵母菌的细胞与**的细胞一样有细胞壁、细胞膜和细胞质等基本结构以及核糖体等细胞器，此外酵母菌细胞还具有一些真核细胞的结构和细胞器，如细胞核有核仁和核膜，DNA与蛋白质结合形成染色体，能进行有丝分裂，细胞质中有线粒体（能量代谢的中心）、中心体、内质网和高尔基体等细胞器以及多糖、脂类等储藏物质（图2-17）。细胞壁的组成成分主要是葡聚糖和甘露聚糖。